新幹線に乗り遅れた場合
新幹線に乗り遅れたケースは過去に私自身も2回ほど経験があります。
指定席を予約していた場合、指定席券は無効となりますが当日の後続列車の自由席であれば利用できます。
自由席の場合はご安心ください。
乗車する列車も座席も決まっていませんので、当日であればどの列車に乗ってもかまいません。
ただし、終電は後続列車がないのでご注意を。
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指定席の場合
予約した指定席の座席はあきらめてください。
出発してしまうと払い戻しも座席の変更もできません。
当日中であれば、同じ区間の自由席に乗ることができます。
追加料金、手続き、申し出のいずれも不要なので後続の好きな列車にお乗りください。
もう一度指定席を予約したい場合は指定席特急料金を再度払わなくてはなりません。
私も指定席で隣席の方があまりにも体臭がひどかったことがあり、同じ列車の自由席に移動したことがあります。
指定席券は必ず指定された座席に座る必要はなく、自由席に座ることもできます。
（後述する早特商品は除く）
（追記 ※20161013山田様よりご指摘）
JRの規約上は、指定席券では同じ列車の自由席に座ることは認められていません。
偶然黙認されただけですので、よほどの事情があれば車掌さんに断ってから移動しましょう。
指定席特急券については、乗り遅れた場合でも指定された列車の乗車日と同じ日のうちなら普通車自由席に限ってご利用できます。なお、指定席に乗車される場合は、指定席特急料金を全額お支払いいただきます。
自由席の場合
同じ区間の列車に乗りましょう。
特に何の心配も手続きも必要ありません。
自由席はどの列車のどの自由席用の座席に座っても良い切符です。
呼び名は、自由「席」ですが、列車を含めて自由という意味です。
自由席の特急券は当日、乗車券は距離に応じて1日から6日のは有効期間があるのでご注意ください。
自由席は2014年4月1日より有効期限が2日から1日に統一されています。
翌日は使えませんのでご注意ください。
IC早特で予約していた場合
当日の自由席を含め、他の列車に乗車することはできません。
再度、特急券料金やグリーン料金を払って購入する必要がありますが、乗車券は有効です。
再度購入する方法（以下のいずれかの方法）
- そのまま後続の列車に乗車し、車内で車掌に申し出て購入する
- エクスプレス予約で再度購入する
- 乗車前にみどりの窓口で購入する
早特商品とは
エクスプレス予約では、３日前や１週間前など早期に指定された列車を予約すると割引サービスがあります。
早特商品での乗り遅れ＝買い直しです。
早特商品は自由席よりも割安なので、安く自由席に乗車する裏技になってしまいます。
▽早特商品について→エクスプレス予約の割引サービス
当日、乗車できなかった場合
翌日以降は利用することができません。
エクスプレス予約で自動的にキャンセル手続きがされ、手数料が差し引かれて払い戻しされます。
▽詳細記事→新幹線の切符の払い戻し
乗車券がお手元にある場合は、有効期間内にみどりの窓口で払い戻し手続きをしてください。
乗車券は距離に応じて１日〜６日の有効期限がありますので、期限を過ぎると払い戻しができません。
予約している列車よりも早い時間の列車に乗る
乗り遅れた場合は後続列車の自由席に乗れるのと同様に早い列車に乗ることもできます。ただし、早特商品、グリーン特典など割引があるお得な切符の場合は不可です。
ホームで待っていて到着した列車の自由席が空いていそうであれば乗ってしまい、早く目的に到着する荒業もあります。
2016年10月14日訂正（山田様からのご指摘による）
私も指摘されて気が付いたのですが、JRの規約ではこの方法は規約違反です。
指定席のきっぷを予約していて、乗り遅れた場合に限った救済措置として後続列車の自由席に乗ることが認められています。
同じ列車や早い時間帯の列車の自由席に乗ることは認められておらず、最悪は切符没収（現実的に無いとは思いますが）となる可能性もあります。
私の場合は偶然、車掌さんも検札で黙認してくれたのです。
誤情報申し訳ありませんでした。
（山田様、情報提供ありがとうございます）
まとめ
エクスプレス予約では予約の変更、キャンセルは無料で何度もできます。
「危ないな」と思ったら直ぐに時間変更をしておきましょう。
といいつつ私も時間を勘違いしていて乗り遅れ、自由席で帰ったことが１回。
出張がキャンセルがされたのに予約していたことをすっかり忘れていたのが１回ありました。
キャンセルでの払い戻しは半額ほど持っていかれるのでかなりのダメージです。
会社も当然払ってくれないので自腹…
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